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なんとかできました。オリジナルと違う点は次のとおり。まだまだバギーですので問題があればご連絡ください。

エンコードの判定順

オリジナルでは

1. NSString:stringWithContentsOfFile:
2. HTML/charset
3. XML/encoding
4. Unicode BOM
5. 環境設定で指定してデフォルトエンコーディング
6. NSUTF8StringEncoding
7. NSISOLatin1StringEncoding
8. NSString:defaultCStringEncoding

の順で逐次変換してうまく変換できたエンコードを採用します。＋NKFCocoaでは、

1. HTML/charset
2. XML/encoding
3. Unicode BOM
4. NSData:guessByNKF(NKFCocoa)
5. NSString:stringWithContentsOfFile:
6. 環境設定で指定してデフォルトエンコーディング
7. NSUTF8StringEncoding
8. NSISOLatin1StringEncoding
9. NSString:defaultCStringEncoding

の順でエンコードを判定します。

読み込み時自動変換

判定したエンコードを使用してNSString:initWithContentsOfFile:encoding:errorしたときエラーになればNSData:stringByNKFWithOptions:error(NKFCocoa>で変換を試みます。ただし、変換をトライするのは判定したエンコードが、Shift_JIS/ISO-2022-JP/EUC-JPの場合に限ります。

保存時の変換

編集したテキストデータがNSString:canBeConvertedToEncoding==FALSEの場合、アラートを表示し現在のエンコードを使用してNSData:stringByNKFWithOptions:errorで変換します。

保存時のエンコード指定

「別名で保存...」「コピーを保存...」でドキュメントを保存する場合、保存パネルからエンコードを指定できるように修正。（この時エンコード指定可能なリストは環境設定で選択しているエンコードのみ）この操作は、「テキストエンコーディング」メニューから編集中のドキュメントのエンコードを変更する操作と同等です。また、保存パネルにある、”拡張子を省略した場合は.txtを使用"は、環境変数で「別名で保存するとき付加する文字列」を設定している場合は無効になります。

ダウンロード

パッチを作るには修正が大きかったので丸ごとお願いします。また、 ソースにはNKFCocoaは同梱していません。別途ダウンロードしてください。